在灵活用工模式下，借助灵活用工平台，许多灵活用工人员能够注册成为个体工商户或其他经营主体。例如，一名自由职业的设计师通过灵活用工平台与企业合作，其身份转变为个体工商户，其收入按照 “经营所得” 纳税，纳税主体变为设计师本人，而非企业。这种转变有效规避了因传统雇佣关系下纳税主体界定模糊而产生的税务风险，使企业在税务处理上更加清晰明确。企业无需再为灵活用工人员的工资薪金所得代扣代缴个人所得税，减少了企业在个人所得税申报和缴纳方面的工作量与风险。
对于企业而言，支付给灵活用工人员的报酬在符合规定的情况下可作为成本列支，并能在企业所得税前扣除。灵活用工平台还会根据国家税收政策及业务实际情况，为企业和灵活用工人员提供合理的纳税建议和方案。例如，对于一些符合小规模纳税人条件的灵活用工个体工商户，平台可指导其充分利用增值税小规模纳税人的税收优惠政策，如季度销售额不超过一定金额可免征增值税等，从而降低整体纳税成本，优化纳税结构，减少税务风险。企业通过合理安排灵活用工业务，能够在合法合规的前提下，最大限度地降低税负，提高企业的盈利能力。
灵活用工平台能够依据企业与灵活用工人员之间真实发生的业务，开具合法合规的发票。比如，企业通过平台雇佣了一批兼职的营销人员，平台会根据营销活动的实际情况，如推广的产品数量、销售业绩以及约定的报酬金额等，开具 “营销服务费用” 发票给企业。这些发票成为企业成本列支的有效凭证，可用于企业所得税等税务申报中的税前扣除，确保企业在税务处理过程中有合法的票据支持，有效避免了因发票问题导致的税务风险，如虚开发票、发票不匹配等违法违规行为。企业凭借这些合规发票，可以顺利实现成本列支，降低应纳税所得额，从而减轻企业所得税负担。
灵活用工平台对发票的开具、使用和传递建立了严格的管理体系，从发票的申请、审核、开具到交付，都有明确的流程和标准。在发票申请环节，平台会对业务的真实性进行详细核实，只有真实发生的业务才能申请发票。例如，通过检查工作任务的发布、承接和完成情况等多方面信息来确认业务真实性。在审核环节，会对发票的内容、金额、开票对象等进行严格审查，确保发票信息准确无误。在开具环节，严格按照税务规定的格式和内容要求开具发票。在交付环节，采用安全可靠的方式将发票送达企业，如通过加密的电子发票传输或正规的邮政渠道寄送纸质发票。这种严谨的发票管理流程，不仅保障了发票的合法性和真实性，也为企业提供了便捷、高效的发票获取途径，进一步降低了企业因发票管理不善而产生的税务风险。